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Caracterización molecular del asno criollo colombiano Equus asinus en el departamento de Sucre usando marcadores moleculares tipo RAMs

Resumen en español

El asno criollo colombiano ha contribuido con el desarrollo de algunos departamentos, estos animales se caracterizan por ser rústicos, adaptados a las condiciones climáticas, por su capacidad de ser alimentados con forrajes de baja calidad nutricional, resistencia a enfermedades, a ectoparásitos, entre otras cualidades ha sido aliadas de los campesinos en las diferentes labores agropecuarias en las son requeridos. Aun así, se encuentra en riesgo de extinción al ser sustituidos algunos de sus usos. Actualmente se desconoce el inventario asnal del país. El objetivo del presente trabajo fue caracterizar genéticamente el asno criollo colombiano Equus asinus en el departamento de Sucre, usando microsatélites amplificados al azar. Para ello se utilizaron 100 individuos ubicados en las cinco subregiones del departamento, se extrajo el ADN y se amplificó por PCR siete cebadores RAMs, dos de los cuales fueron monomórficos y excluidos de los análisis. Se encontraron un total de 291 bandas, 11.96±1.45 en promedio por cebador, el valor más alto en CCA (18±2.23) y el menor en TG y GT (8.8±0.44). El cebador más polimórfico (88.09±10.91%) y con mayor He (0.376±0.021) fue CA, mientras que el menor fue GT (34.12±7.06% y 0.101±0.040 para % de loci polimórfico y He, respectivamente), aunque solo en este marcador se encontraron loci poco frecuentes. El análisis intrapoblacional mostró un promedio de 66.50±1.72 bandas de las cuales el 89.86±24.04% fueron polimórficas. La subpoblación GO presento el mayor número de bandas (63) y el menor se encontró en MO (48), sin embargo, el valor más alto % de loci polimórfico (81.16%) y He (0.335±0.022) se encontró en la subpoblación MM, siendo esta la más diversa. El promedio de diversidad genética encontrado fue de 0.351±0.021 para toda la población. El análisis de estructura poblacional mostró, un 10% de variación entre subpoblaciones, con un valor de FST de 0.17±0.01 (p<0.05). Las distancias genéticas entre subpoblaciones ubican a MO y GO como las distantes. Se concluye que los marcadores RAMs con eficientes evaluando la diversidad genética del asno, esta raza criolla tienen medios valores de diversidad genética, además, que la estructura genética encontrada puede ser resultado de las barreras geográficas naturales en las subregiones estudiadas.