Publicación: Comparación y utilidad de tres métodos de extracción de ADN a partir de potenciales vectores de enfermedades rickettsiales (Acari: Ixodidae) en Colombia.
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Resumen en inglés
The study of diseases transmitted for tick as rickettsia is of great interest to medical and veterinary level and requires the use of extracts of good quality DNA for subsequent analysis of amplified genes of these pathogens. In this study, three methods were compared DNA extraction from ticks complex Rhipicephalus sanguineus based on: chaotropic guanidine thiocyanate (method 1), high salt (method 2) and an extraction method based on commercially available columns (Method 3). The DNA was quantified and the quality of each extract in the amplification of the 16S gene ticks (360pb) was evaluated, a nonparametric Kruskal-Wallis one-way analysis was performed, while comparing the amplification efficiency of mitochondrial gene was performed by Dunn test range. Method 3 allowed the amplification of the 16S gene of ticks in 100% (30/30) followed by method 1 with 93.33% (28/30) and finally with method 2 86.66% (26/30). The three methods are efficient at extracting genetic material of high quality tick-borne studies since their performance in amplification of mitochondrial genes tick agents.
Resumen en español
El estudio de enfermedades transmitidas por garrapatas como rickettsiosis, es de gran interés a nivel médico-veterinario y requiere la utilización de extractos de ADN de buena calidad para posteriores análisis de amplificación de genes de estos agentes patógenos. En este estudio se compararon tres métodos de extracción de ADN a partir de garrapatas del complejo Rhipicephalus sanguineus basados en: agente caotrópico Tiocianato de Guanidina (método 1), alta concentración de sales (método 2) y un método de extracción basado en columnas disponible comercialmente (método 3). El ADN obtenido fue cuantificado y se evaluó la calidad de cada extracto en la amplificación del gen 16S de garrapatas (360pb), se realizó una prueba no paramétrica de Kruskal-Wallis, mientras que la comparación de la eficiencia de amplificación del gen mitocondrial fue realizada por una prueba de rango de Dunn. Con el método 3 permitió la amplificación del gen 16S de garrapatas en 100% (30/30), seguida por el método 1 con 93.33% (28/30) y finalmente el método 2 con 86.66% (26/30). Los tres métodos son eficientes en la extracción de material genético de alta calidad para estudios de agentes transmitidos por garrapatas dado su desempeño en la amplificación de genes mitocondriales de garrapatas.