Publicación:

Bacteias rendófitas aisladas del cultivo de ñame (dioscorea spp.) con produccion de metabolitos con actividad antifúngica contra colletotrichum gloeosporioides penz. en el departamento de Sucre

Resumen en español

El hongo Colletotrichum gloeosporioides es el agente causal de la antracnosis en ñame en el departamento de sucre, esta enfermedad es el principal factor limitante en la producción de este tubérculo a nivel mundial. Las bacterias endófitas han sido objeto de estudio debido a las propiedades benéficas demostrada en la promoción del crecimiento de las plantas y la capacidad de biocontrol contra fitopatógenos, siendo propuestas en diversas literaturas especializadas como una alternativa para el control químico. El presente proyecto tuvo como objetivo aislar bacterias endófitas de diferentes tejidos de especies de ñame resistentes a la antracnosis y evaluar in vitro su actividad inhibitoria contra C. gloeosporioides, agente causal de la antracnosis en cultivos de ñame, en zonas productoras del departamento de Sucre. Para esto, se colectaron muestras de raíz, tallos y hojas de especies de ñame provenientes de diferentes zonas agroecológicas del departamento de Sucre. Cada tejido colectado se sometio a un proceso de desinfección superficial, seguidamente se realizó el aislamiento de bacterias endófitas sobre la superficie de medio agar R2A, y se determinó la densidad poblacional (UFC/ g de tejido). Los morfotipos aislados fueron purificados para evaluar in vitro la actividad inhibitoria de suspensiones bacterianas y de compuestos tipo metabolitos, contra C. gloeosporioides. Los metabolitos fueron identificados por cromatografía de gases acoplada a masa, y las bacterias productoras de compuestos tipos metabolitos fueron identificadas a nivel molecular, por medio de la extracion de ADN genómico, amplificación del ADNr utilizando oligonucleótidos específicos para eubacterias y finalmente secuenciamineto de productos de la amplificación. Los resultados obtenidos muestran mayor densidad poblacional de bacterias en la raíz con respecto a tallo y hojas. En la prueba de confrontación se encontraron cuatro morfotipos de bacterias endófitas productoras de metabolitos. El medio de cultivos para la obtención de metabolitos fue optimizado con diferentes fuentes de carbohidratos encontrándose que el medio con caldo nutritivo, buffer y glicerol como el más óptimo. El análisis de los perfiles cromatográfico de los extractos con actividad antifúngica reveló la presencia de 32 metabolitos como constituyentes, de los cuales la pirrolnitrina ha sido reportado por la bibliografía por poseer propiedades antifúngicas contra un amplio espectro de hongos fitopatógenos como C. gloeosporioides. Se identificaron cuatro cepas de bacterias endófitas que muestran alta homología con secuencias de especies de bacterias relacionadas a Burkholderia cepacia. Los resultados obtenidos sugieren continuar con otros estudios para continuar evaluando la actividad antifúngica de estas bacterias contra C. gloeosporioides y a futuro ser una alternativa biológica nativa para el manejo en campo de la antracnosis en cultivo de ñame en el departamento de Sucre.