Caracterización molecular y diversidad genética de poblaciones de colletotrichum gloeosporioides aislados de ñame (dioscorea spp) en tres zonas agroecológicas del caribe Colombiano
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Baquero Garrido, María José | 2017
El ñame pertenece a la familia Dioscoreacea genero Dioscorea. Es una planta de importancia económica en regiones pluviosas tropicales y subtropicales cuyos tubérculos son considerados como producto esencial para la alimentación de millones de personas en África, Asia y América latina. En Colombia se cultiva mayormente en la región Caribe siendo Sucre, Córdoba y Bolívar los mayores productores, jugando un papel fundamental en la seguridad alimentaria regional. No obstante, el ñame se ve afectado por diferentes problemas entre los cuales se encuentra su susceptibilidad a hongos del genero Colletotrichum, siendo C. gloeosporioides la especie de mayor importancia, causante de la enfermedad conocida como antracnosis.
La presente investigación tuvo como objetivo la caracterización molecular y el análisis de la diversidad genética de poblaciones del hongo C. gloeosporioides a partir de tres zonas agroecologicas del caribe colombiano, los aislados pertenecientes a la colección de hongos de la Universidad de Sucre fueron hidratados y subcultivados en medio solido PDA, sometidos a una detallada revisión de sus características morfológicas macro y microscópicas; esta evaluación se realizó por microscopia de luz, utilizando examen directo con lactofenol o azul de algodón, la determinación morfológica se hizo con ayuda de claves taxonómicas. Posteriormente, se Identificaron los aislados de la especie C. gloeosporioides molecularmente mediante PCR especifico con los cebadores ITS 4 y CgInt, las cepas confirmadas molecularmente como C. gloeosporioides se caracterizaran genéticamente mediante marcadores tipo MP-PCR, los cálculos fueron realizados con el uso del software el GENALEX, utilizando para ello el análisis de varianza molecular (AMOVA), lo que permitió el análisis de la estructura y diversidad y genética.
Los resultados encontrados mostraron que Colletotrichum gloeosporioides presenta una alta diversidad genética dentro de las poblaciones estudiadas, indicando mayor variacion genética en las poblaciones de Mateo Perez (0,66) y la Siria (0,49) en comparación con Chinu y San Jacinto con un valor menor a 0,135, y baja estructura genética, debido posiblemente al alto flujo genético en las poblaciones estudiadas, el alto flujo genético entre las poblaciones estudiadas no está relacionado con la distancia geográfica, pero si con el número de migrantes, es decir que entre mayor es la distancia genética menor es el número de migrantes en una población. En consecuencia todas las poblaciones tienen suficiente flujo génico para no divergir entre ellas por deriva génica, permitiendo la acción efectiva de la selección natural.
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